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短信删除了仍然出现红色数字提示，可能是由于以下原因。
1、短信应用中的“通知”或“消息”按钮上显示的数字提示，表示的是该应用内未读消息的总量，即使已经删除某些消息，只要还有未读消息，这个数字就不会消失，需要进入短信应用，查看并阅读所有的未读消息后，该数字才会消失。
2、手机系统通知栏中的短信应用图标上的红色数字提示，可能是因为短信的计数功能，即使删除了某些短信，只要未进行清空操作，已删除短信的记录仍然会计算在内，导致出现红色数字提示，可以尝试进入短信设置，查看是否有相关的计数或通知设置，并进行调整。
如果以上方法都无法解决问题，建议查看手机的使用说明书或联系手机制造商的客服进行咨询。